Okulumuz  ilk defa 1953 yılında MUŞ Merkez TCDD İstasyonunun gar binalarında " SAPNA İLKOKULU " adıyla açılmış olup geçici olarak eğitim-öğretime başlayarak 1960 yılına kadar bu şekilde eğitim-öğretimi sürdürmüştür.1961 yılında okulumuzun adı değişerek " İSTASYON İLKOKULU " 1964 yılına kadar öğretime devam etmiştir.1965 yılında okulumuzun ismi tekrar değişerek " SÜTLÜCE İLKOKULU " adıyla 1978 yılına kadar eğitim-öğretimini sürdürmüştür.

       1979-1980 Eğitim-Öğretim Yılında tekrar ismi değişerek " İSTASYON İLKOKULU " adıyla eğitim-öğretime devam etmiştir.

       Mahallemizin zamanla gelişmesi ve nüfus artışı nedeniyle yeni bir okula ihtiyaç duyulmuştur. İhtiyacı karşılayacak şekilde planlanan okulumuzun temeli 1978 yılında atılmış ve 3 yıl içinde tamamlanarak 1981 yılında eğitim-öğretime açılmıştır.Okulumuzun açılışı Büyük Önder Mustafa Kemal ATATÜRK ' ün doğumunun 100. yılına rastlaması ve ilgili tarihte mahallenin isminin ZAFER olması nedeniyle " 100. YIL ZAFER İLKOKULU " adı verilmiştir.1991 yılında temeli atılan ek binanın 1992-1993 Eğitim-Öğretim Yılında hizmete girmesi ilköğretime geçiş yapılmış olup, adı değişen okulumuz " 100. YIL ZAFER İLKÖĞRETİM OKULU " adını alarak halen eğitim-öğretimini sürdürmektedir.